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Fiche de cours

Chapitres choisis de Microbiologie

Advanced Microbiology courses

Faculté de gestion: Ecole de biologie (FBM-BIO)

Responsable(s): Dominique Sanglard

Période de validité: 2008 -> 2008

Pas d'horaire défini.

Cours

Semestre d'automne
42 heures par semestre

Langue(s) d'enseignement: anglais, français
Public: Sur demande écrite au décanat
Crédits: 7.00

Objectif

Elargissement des connaissances sur divers domaines actuels relevants de
la Microbiologie et comprenenant les microorganismes suivants: Bactéries,
Champignons et levures ainsi que les virus

Contenu

- Potentiel de la génétique bactérienne (D. Haas)
1. Mutants conditionnels létaux
2. Analyse mutationnelle
3. Suppression des mutations « nonsense »
4. Muations insertionnelles
5. Phénotype « Mutator »

- Petits ARN et Régulation (C. Reimmann)
1. Introduction sur les petits ARN chez les bactéries
2. Petits ARN de maintien (4.5S ARN, tmARN, ARNse P ARN)
3. ARN Régulateurs: Mechanismes et exemples
4. Journal des clubs sur:
- ARN Régulateurs interagissant avec des ARNm cibles
- ARN Régulateurs interagissant avec des protéines
- Comment trouver des ARN Régulateurs
- Analyse spectroscopique de petits ARN en action


- Bioreporters (J. Van der Meer)
1. Utilisation générale de bioreporters en microbiologie et en sciences de l'environnement
2. Principes de conception de circuits génétiques pour bioreporters
3. Types et spécificités de protéines raportrices
4. Bioreporters bactériens et biodisponibilité
5. Des exemples pratiques de bioreporters: utilisation et future

- Champignons et levures pathogènes: aspects fondamentaux (D. Sanglard)
1. Généralités sur les champignons pathogènes
Candida, Cryptococcus, Aspergillus, Pneumocystis, Dermatophytes
2. Relation hôte/pathogène, virulence et dimorphisme
3. Paroi des champignons
4. Article: effet de la composition de la paroi sur la réponse immunitaire

- Bases moléculaires de la virulence virale
1.Pathogenèse virale au niveau cellulaire: subversion des systèmes de synthèse de la cellule hôte, autres lésions ; effets cytopathogènes (inclusions).
- Papier discuté : Zhi-yong Yang et al. Identification of the Ebola virus glycoprotein as the main viral determinant of vascular cell cytotoxicity and injury Nature Medicine 6, 886 - 889 (2000)
2.Induction des mécanismes d'immunité innée (ligands lié s aux membranes (TLR) et cytoplasmiques (NOD). Signalisation conduisant à l'expression des gènes régulés par l'interferon. Subversion de ce signaling par les virus.
- Papier discuté : Hui Zeng et al, Highly Pathogenic Avian Influenza H5N1 Viruses Elicit an Attenuated Type I Interferon Response in Polarized Human Bronchial Epithelial Cells. J Virol, 2007, 81:12439-12449
3.Les gènes effecteurs antiviraux (Trim5-alpha, Apobec. Protéine Mx, etc) et subversion de ces gènes par les virus.
-Papier présenté : Stremlau et al, The cytoplasmic body component TRIM5alpha restricts HIV-1 infection in Old World monkeys. Nature. 2004 ;427:848-53


- Bases moléculaires de la virulence bactérienne
1.Introduction générale sur les facteurs de virulence (G. Greub)
2.Exotoxines et adhérence: Staphylococcus aureus (G. Greub)
3.EIEC, ETEC et EPEC : Escherichia coli (P.Hauser)
4.Les filaments d'actine, le mont d'or et Listeria monocytogenes (J. Bille)
5.Spores, toxines et anthrax : Bacillus antracis (J. Bille)
6.Résistance aux macrophages : M. tuberculosis (G. Greub)
7.BadA ou comment faire construire sa niche réplicative: Bartonella spp. (G. Greub)
8.Système de sécretion de type III et inclusions : les chlamydia (G. Greub)


- Séminaires d'institut

Bibliographie

- Silhavy & Beckwith « The Power of Bacterial Genetics »
a literature-based course, Cold Spring Hartbor Laboratory Press, 1992
- Ad hoc specific scientific manuscripts

Canton de Vaud
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