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Fiche de cours

Modélisation spatiale des données naturelles - Analyses multivariées

Spatial modelisation of natural data - Multivariate analyses

Faculté de gestion: Faculté des géosciences et de l'environnement (FGSE)

Responsable(s): Antoine Guisan, Christophe Randin
Intervenant(s): -

Période de validité: 2009 -> 2011

Pas d'horaire défini.

Cours-Exercices

Semestre de printemps
8 djb heures par semaine

Langue(s) d'enseignement: français
Public: Oui
Crédits: 0

Objectif

Enseigner les bases de biogéographie, de statistique et de méthodologie nécessaire à la compréhension, l'ajustement et l'évaluation des modèles prédictifs de distribution d'espèces et des communautés biologiques.

Contenu

Cet enseignement comprend des cours théoriques, des travaux pratiques et des lectures et présentations d'articles scientifiques. Les cours enseignent les bases théoriques et statistiques de la modélisation de distribution d'espèces et de communautés biologiques. Les travaux pratiques sont basés sur les logiciels R (statistiques) et ArcGIS. Des articles sont assignés le premier jour à des groupes de 2-4 étudiants. Ils sont présentés oralement lors du dernier cours.

Cours théoriques:
1. Théorie, postulats de base et principes de base des modèles prédictifs de distribution d'espèces (PSD)
2. Approches pour données de présences
3. Approches par discrimination de groupes et approches quantitatives
4. Evaluation des modèles et de leur incertitudes
5. Echantillonnage des données pour les modèles
6. Modélisation d'ensemble et incertitudes
7. Modélisation d'assemblages d'espèces (communautés)

Travaux pratiques:
TP1. Introduction aux SIG et à R
TP2. Introduction aux modèles linéaires généralisés (GLMs)
TP3. Introduction aux modèles additifs généralisés (GAMs)
TP4. Evaluation des modèles
TP5. Implémentation de scénarios de changement climatique

Articles:
1 pour 3-4 étudiants, choisis pour représenter différentes applications des SDMs.

Evaluation

Travail pratique doit être jugé suffisant pour pouvoir présenter l'article - note finale de la présentation d'article

Bibliographie

Franklin, J. (2010) Mapping species distribution: spatial inference and prediction. Cambridge University Press, Cambridge.

Guisan, A., Thuiller, W. & Zimmermann, N.E. (in prep.) Habitat suitability models in ecology. Cambridge University Press.

Exigences du cursus d'études

Bases de biologie générale (niveau maturité), statistiques de base

Unicentre - CH-1015 Lausanne - Suisse
Tél. +41 21 692 11 11
Canton de Vaud
Swiss University