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Fiche de cours

Sequence a genome I

Sequence a genome

Faculté de gestion: Ecole de biologie (FBM-BIO)

Responsable(s): Jan Roelof van der Meer

Période de validité: 2010 -> 2010

Pas d'horaire défini.

Exercices

Semestre d'automne
42 heures par semestre

Langue(s) d'enseignement: anglais
Public: Non
Crédits: 0

Objectif

L'objectif du cours est de apprendre, comprendre et faire tout le trajet de l'isolation d'ADN d'une bactérie jusqu'au séquençage, assemblage et annotation du génome.

Contenu

Théorie du séquençage classique et haute débit
Isolation et purification d'ADN génomique bactérienne
Théorie et pratique du système UNIX
Théorie et pratique des programmes d'assemblage
Stratégie de 'gap closure' par PCR
PCR et finissage de l'assemblage
Annotation automatique et manuelle en utilisant GenDB
Présentation des résultats en forme manuscrit.

Canton de Vaud
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