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Fiche de cours

Statistiques pour biologistes

Statistics for Biologists

Faculté de gestion: Ecole de biologie (FBM-BIO)

Responsable(s): Jérôme Goudet, Valentin Cédric Michel Rousson, Frédéric Schütz

Période de validité: 2011 -> 2011

Pas d'horaire défini.

Cours

Annuel
42 heures par année

Langue(s) d'enseignement: français
Public: Oui
Crédits: 7.00

Objectif

-Familiariser l'étudiant avec les concepts et les outils statistiques qu'il utilisera dans son activité
-Familiarisation avec le type de données rencontrées en Biologie
-Apprentissage d'un logiciel de statistiques du domaine publique (sous license publique GNU): le logiciel R (disponible à l'url suivante : CRAN)

Contenu

Premier semestre (Rousson/18 heures cours)
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1. Concepts statistiques de base

Population, variable, échantillon

2. Statistique descriptive

Table de contingence, proportions
Distribution qualitative, continue, binaire, normale
Barplot, histogramme, boxplot, quantiles
Moyenne, médiane, variance, écart-type, skewness, kurtosis

3. Estimation

Distribution d'un estimateur, espérance, biais, erreur-type
Estimation d'une moyenne, d'une variance, d'une proportion

4. Intervalle de confiance

Intervalle de confiance pour une moyenne, pour une proportion
Méthode de Wald, de Student et de Wilson

5. Comparaison de deux groupes

Différence de moyennes, différence de proportions, différence de moyennes standardisée

6. Principe d'un test statistique

Hypothèse nulle et hypothèse alternative
Valeur p, seuil d'un test
Test unilatéral et test bilatéral
Dualité test statistique et intervalle de confiance

7. Tests statistique classiques

T-tests, tests de Wald, tests du chi-deux, tests pour données pairées

2e semestre
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J. Goudet : (12 heures)
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1. Introduction à l'analyse de variance (ANOVA), corrections pour tests multiples : Bonferroni et False Discovery Rates (FDR)

2. L'analyse de variance à 1 facteur: Effets fixes et effets aléatoires

3. L'analyse de variance à 2 facteurs hiérarchiques, l'analyse de variance à 2 facteurs croisés

4. L'analyse de Covariance (ANCOVA)

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V. Rousson : (12 heures)
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1. Analyse de corrélation

2. Régression linéaire simple

3. Régression linéaire multiple

4. Cas particuliers de régression


Bibliographie

P. Dalgaard. Introductory Statistics with R. Springer, 2002
MC Whitlock, D Schluter. The Analysis of Biological Data. Roberts & Co, 2008
R. R. Sokal and F. J. Rohlf. Biometry. Freeman, 1981
J. H. Zar. Biostatistical Analysis. Prenctice Hall, 1984

Exigences du cursus d'études

Programme d'enseignement en maths du BSc 1 ou connaissances équivalentes

Canton de Vaud
Swiss University
Unicentre  -  CH-1015 Lausanne  -  Suisse  -  Tél. +41 21 692 11 11  -  Fax  +41 21 692 26 15