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Fiche de cours

Modèles prédictifs de distribution des espèces

Predictive Models of Species' Distribution

Faculté de gestion: Ecole de biologie (FBM-BIO)

Responsable(s): Antoine Guisan
Intervenant(s): -

Période de validité: 2012 -> 2012

Pas d'horaire défini.

Exercices

Semestre de printemps
14 heures par semestre

Langue(s) d'enseignement: anglais
Public: Sur demande écrite au décanat
Crédits: 0

Objectif

Les modèles prédictifs de distribution des habitats potentiels d'organismes (MPD) prennent toujours plus d'importance en biologie de la conservation. Ce cours se propose de présenter les différentes approches existantes, et leurs avantages et limitations respectifs, ainsi que les différentes étapes de construction d'un MPD, telles que la préparation des prédicteurs environnementaux, l'ajustement du modèle, les prédictions spatiales dans un SIG ou l'évaluation des prédictions. Les différentes approches prédictives seront particulièrement discutées dans différents contextes de biologie de la conservation (changements climatiques, espèces rares, espèces invasives)

Contenu

Chap 1. Introduction générale. Théorie biologique derrière les modèles: concept de la niche, la notion d'espèce et les assemblages d'espèces, pseudo-équilibre, compétition, dispersion, autocorrélation spatiale, conservatisme de la niche; Survol des principales approches prédictives selon type de variable réponse ; Données utilisées (sp et prédicteurs) et échantillonnage de terrain
Chap. 2. Modèles avec présence-seulement. Problème des absences et distribution à l'équilibre. Théorie statistique derrière les modèles de présence-seulement : Enveloppes, ENFA, ACP-espèce. Pseudo-absences
Chap. 3. Modèles de présence-absence et abondance/diversité. Théorie statistique derrière les modèles de régression: lois de distribution, tests d'inférence et permutation, maximum de vraisemblance, déviance expliquée, techniques de sélection - lien entre modèles statistiques et théorie écologique - Implémentation des modèles statistiques dans un SIG - cartes d'incertitude ; Mesures d'abondance et de diversité et modèles correspondants (Poisson, ordinal, etc..). Prédictions et évaluation
Chap. 4. Evaluation des modèles : p/a, po, abondance/diversité. Evaluation interne (rééchant.) vs externe (données indép.): validation croisée, jackknife, bootstrap, prédiction dans nouvelle région (transposabilité), incertitudes, MPA
Chap. 5. Modélisation assemblages d'espèces - reconstruction de communautés/diversité. Modèles multi-espèces : CCA, multivariate CART, multivariate ANN - assemblages de modèles individuels d'espèces - approche alternative GDM (Global Dissimilarity Modelling)
Chap. 6. Scénarios de changements climatiques - migrations d'espèces et incertitudes dans les projections. Scénarios actuels - « range shifts » - incertitudes dans les projections - implications pour la conservation

Bibliographie

Guisan, A. & Zimmermann, N.E. (2000). Predictive habitat distribution models in ecology. Ecological Modelling 135(2-3): 147-186.
Guisan A, Thuiller W (2005) Predicting species distribution: offering more than simple habitat models. Ecology Letters, 8, 993-1009.

Exigences du cursus d'études

Cours d'Analyse Spatiale du Master BEC au semestre précédent (non strictement nécessaire).

Informations supplémentaires

http://www.unil.ch/ecospat

Unicentre - CH-1015 Lausanne - Suisse
Tél. +41 21 692 11 11
Canton de Vaud
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