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Fiche de cours

Travaux pratiques de biologie moléculaire

Practical Work in Molecular Biology

Faculté de gestion: Ecole de biologie (FBM-BIO)

Responsable(s): Christiane Nawrath, Pascal Schneider, Vladimir Sentchilo, Johann Weber

Période de validité: 2014 -> 2014

Pas d'horaire défini.

Travaux pratiques

Semestre d'automne
112 heures par semestre

Langue(s) d'enseignement: anglais, français
Public: Non
Crédits: 0

Objectif

1) Apprendre un large éventail des techniques modernes utilisées en biologie moléculaire.
2) Apprendre comment ces techniques sont utilisées pour un projet de recherche bien défini afin de comprendre la conception logique des expériences.
3) Apprendre à interpréter les résultats obtenus et la façon de les communiquer sous forme d'un rapport scientifique et / ou d'une présentation orale.

Contenu

Les TP sont donnés par cinq départements (CIG, DB, DMF, DBMV, IBT) en blocs parallèles entre lesquels les étudiants peuvent choisir. Chaque TP contient son propre "thème", ce qui, comme une ligne rouge, permet aux étudiants d'appliquer successivement les différentes techniques afin de répondre au problème scientifique. Bien que la plupart des méthodes soient utilisées dans les cinq blocs, certaines sont plus spécifiques à un thème précis.
Les 4 thèmes sont:
CIG: P53 - du clonage d'ADNc à l'étude de localisation in vivo dans les cellules de mammifères
DB: Famille du TNF. Clonage, expression et purification de protéines recombinantes
DMF: Analyse moléculaire du métabolisme de 2-hydroxybiphenyl dans Pseudomonas azelaica
DBMV: Caractérisation de la lipoxygènase LOX1 d'Arabidopsis thaliana
Les techniques utilisées dans les 5 blocs sont:
Isolation d'ADN (tous)
PCR (tous)
Analyse avec enzymes de restriction (tous)
Clonage d'ADN (tous)
Séquençage d'ADN (tous)
Southern blot (DMF)
Isolation d'ARN (DMF, DB, DBMV, IBT)
Synthèse d'ADNc (CIG, DB, DBMV, IBT)
Northern blot (DMF, DBMV)
PCR quantitative avec SYBR Green (DB, DBMV, IBT)
Surexpression des protéines (tous)
ELISA (DB, IBT)
SDS PAGE (tous)
Western blot (tous)
Purification des protéines par affinité (CIG, DB)
Filtration sur gel, déglycosylation, immunoprécipitations (DB)
Extraction et analyse de lipides (DB)
Cinétique enzymatique (DMF)
Système rapporteur Lux et/ou GFP (CIG, DMF, DBMV, IBT)
Microscopie à fluorescence (CIG, DB, IBT, DBMV)
Mutagenèse par transposon ou mutagenèse dirigée (CIG, DB, DMF)
Génotypage des mutants ADN-T (DBMV)
Culture de cellules et transfection (CIG, DB, IBT)
Analyse de cellules par FACS (IBT)

Evaluation

La note des travaux pratiques tient compte du travail en laboratoire et des présentations finales (orales et écrites).

Bibliographie

Polycopies donnés par les 4 départements au début des travaux pratiques.

Exigences du cursus d'études

Cours de biologie moléculaire donné par E. Farmer

Unicentre - CH-1015 Lausanne - Suisse
Tél. +41 21 692 11 11
Canton de Vaud
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