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Fiche de cours

Metabolomics in life sciences: approaches, applications and challenges/Introduction à la métabolomique dans les sciences du vivant - 45a/Série 2

Faculté de gestion: Ecole doctorale (FBM-DOCT)

Responsable(s): Julijana Ivanisevic, Aurélien Thomas

Période de validité: 2015 ->

Horaires du cours (Apériodique)

Date Lieu Remarque Thématique Intervenant(s)
22.01.2020 de 10:00 à 12:00 Pierre Decker (BU19 04), CHUV Metabolome: Downstream of Genome Julijana Ivanisevic, Aurélien Thomas
29.01.2020 de 10:00 à 12:00 Pierre Decker (BU19 04), CHUV Metabolomic workflow: Untargeted versus targeted Julijana Ivanisevic, Aurélien Thomas
05.02.2020 de 10:00 à 12:00 Pierre Decker (BU19 04), CHUV Data processing & statistical analyses Julijana Ivanisevic, Aurélien Thomas
12.02.2020 de 10:00 à 12:00 Salle de séminaire 609 - BU19.04 Integrated metabolomics to systems biology approaches Julijana Ivanisevic, Aurélien Thomas
19.02.2020 de 10:00 à 12:00 Pierre Decker (BU19 04), CHUV New Leading-Edge Approaches in Metabolomics Julijana Ivanisevic, Aurélien Thomas

Tutorial (optionnel)

Annuel
Apériodique
Langue(s) d'enseignement: anglais, français
Public: Oui
Crédits: 1.00

Objectif

Le métabolome reflète la réponse ultime d'un système biologique par rapport aux changements génétiques et environnementaux. L'intégration de la métabolomique aux autres approches omique amène de grandes opportunités dans les domaines biologiques et cliniques. Ce cours permettra aux étudiants d'acquérir une connaissance de base en métabolomique, notamment au niveau de son implication en recherche clinique et fondamentale.

Contenu

Le tutorial donnera un aperçu général sur les approches récentes en métabolomique. Les processus analytiques et bioinformatiques ainsi que les challenges associés seront discutés en détails. Des exemples pratiques, basés sur des publications et des données expérimentales, seront discutés avec les étudiants afin de mieux comprendre comment cette technologie peut être appliquée, ses limitations actuelles et comment elle peut être intégrée avec d'autres approches omiques dans une vision de biologie des systèmes.

Evaluation

Travail personnel : Oui
Présentation : Oui
Test final : Non
Evaluation de la participation par le tuteur: Oui
Attestation de participation au doctorant : Oui

Bibliographie

1) Patti, G. J., Yanes, O. & Siuzdak, G. Innovation: Metabolomics: the apogee of the omics trilogy. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 13, 263-269 (2012).
2) Johnson, C. H., Ivanisevic, J. & Siuzdak, G. Metabolomics: beyond biomarkers and towards mechanisms. Nat. Rev. Mol. Cell Biol., doi:10.1038/nrm.2016.25 (2016).
3) Norris JL, Caprioli RM Analysis of tissue specimens by matrix-assisted laser desorption/ionization imaging mass spectrometry in biological and clinical research. Chem Rev. 10, 2309-42 (2013)

Exigences du cursus d'études

Le tutorial est ouvert à tous. Des connaissances basiques en spectrométrie de masse, chimie analytique et statistiques représentent un plus.

Conditions d'octroi

Evaluation positive de la participation active par le tuteur.

Conditions d'accès

Inscription auprès de l'Ecole doctorale. Série 2.

Canton de Vaud
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