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Fiche de cours

Bioinformatics Algorithms - ED 24/Série 3

Faculté de gestion: Ecole doctorale (FBM-DOCT)

Responsable(s): Christophe Dessimoz, David Gfeller

Période de validité: 2016 ->

Horaires du cours (Apériodique)

Date Lieu Remarque Thématique Intervenant(s)
27.02.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   Christophe Dessimoz
05.03.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   Christophe Dessimoz
12.03.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   Christophe Dessimoz
19.03.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   Christophe Dessimoz
26.03.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   Christophe Dessimoz
02.04.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   David Gfeller
09.04.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   David Gfeller
23.04.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   David Gfeller
30.04.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   Christophe Dessimoz
07.05.2020 de 09:00 à 12:00 Salle 336, Bâtiment Amphipôle, UNIL-Sorge, 1015 Lausanne   Christophe Dessimoz

Cours

Annuel
Apériodique
Langue(s) d'enseignement: anglais
Public: Oui
Crédits: 3.00

Objectif

The course aims at improving the student's programming skills by gaining a deep understanding of
some of the key algorithms in bioinformatics, with a special emphasis on sequence and graph
algorithms. Students will learn widely applicable concepts, such as asymptotic time complexity,
binary search, dynamic programming, hashing.
Practicals and home assignments are essential parts of the course.
The language of the course is Python, though the concepts covered in the course are applicable to
all computer languages.

Evaluation

Mandatory assessment: 20 min oral examination
Final test that will take place in summer exam session, 12.6 - 06.07-2019 (date will be provided during the course).


Exigences du cursus d'études

The course assumes familiarity with basic programming concepts (variable and
function declaration, arrays, for-loops, conditional statements, etc.). Algorithms are introduced from
a practical angle so the mathematical formalism is kept at a minimum.

Conditions d'octroi

Participation active attestée par le responsable.

Conditions d'accès

Inscription auprès de l'Ecole doctorale. Série 3

UtilisationCode facultéStatutCrédits
Doctorat en médecine et ès sciences (MD-PhD) (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctoraleED-FBMOptionnel3.00
Doctorat ès sciences de la vie (2003 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctoraleED-FBMOptionnel3.00
Doctorat ès sciences de la vie - Ecology and Evolution (2007 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctoraleED-FBMOptionnel3.00
Doctorat ès sciences de la vie - programme Cancer and Immunology (2008 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctoraleED-FBMOptionnel3.00
Doctorat ès sciences de la vie - programme Cardiovasculaire et métabolisme (2005 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctoraleED-FBMOptionnel3.00
Doctorat ès sciences de la vie - programme Integrated Experimental and Computational Biology (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctoraleED-FBMOptionnel3.00
Doctorat ès sciences de la vie - programme Microbial Sciences (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctoraleED-FBMOptionnel3.00
Doctorat ès sciences de la vie - programme Quantitative Biology (2018 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctoraleED-FBMOptionnel3.00
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