Fiche de cours
Introduction à la conception de médicaments assistée par ordinateur/Introduction to computer-aided drug design - ED 30/Série 4
Faculté de gestion: Ecole doctorale (FBM-DOCT)
Responsable(s): Vincent Zoete
Pas d'horaire défini.
Cours
Annuel
Langue(s) d'enseignement: anglais, français
Public: Oui
Crédits: 1
Objectif
L'objectif de ce cours est de présenter les bases de la visualisation de la structure des protéines, et les concepts de la conception de médicaments assistée par ordinateur à l'aide d'outils développés au SIB. Plusieurs exemples sont pris de différentes cibles thérapeutiques.
Contenu
. UCSF Chimera pour visualiser des molécules en 3D, analyser des complexes ligand-protéine, et effectuer des dockings
. SwissBioisostere pour l'optimization de lead
. SwissADME pour l'estimation de paramètres pharmacocinétiques et dynamiques, etc.
. SwissTargetPrediction pour prédire les cibles primaires et secondaires des petites molécules
. introduction au docking QM/MM
Evaluation
Travail personnel de préparation: Non
Présentation personnelle: Non
Test final: Oui
Evaluation de la participation par l'enseignant: Non
Bibliographie
-
Exigences du cursus d'études
Compétences: connaissances de bases en biologie et quelques connaissances de bases en chimie.
Technique: laptop avec une souris et deux softwares installés: UCSF Chimera et une version récente de Firefox ou Chrome.
Conditions d'octroi
Evaluation positive de la participation active par le tuteur.
Conditions d'accès
Inscription auprès de l'Ecole doctorale. Série 4.
Utilisation | Code faculté | Statut | Crédits |
---|---|---|---|
Doctorat en médecine et ès sciences (MD-PhD) (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctorale | ED-FBM | Optionnel | 1.00 |
Doctorat ès sciences de la vie (2003 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctorale | ED-FBM | Optionnel | 1.00 |
Doctorat ès sciences de la vie - Ecology and Evolution (2007 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctorale | ED-FBM | Optionnel | 1.00 |
Doctorat ès sciences de la vie - programme Cancer and Immunology (2008 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctorale | ED-FBM | Optionnel | 1.00 |
Doctorat ès sciences de la vie - programme Cardiovasculaire et métabolisme (2005 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctorale | ED-FBM | Optionnel | 1.00 |
Doctorat ès sciences de la vie - programme Integrated Experimental and Computational Biology (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctorale | ED-FBM | Optionnel | 1.00 |
Doctorat ès sciences de la vie - programme Microbial Sciences (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctorale | ED-FBM | Optionnel | 1.00 |
Doctorat ès sciences de la vie - programme Quantitative Biology (2018 ->) ›› Cours de 3e cycle de l'Ecole doctorale | ED-FBM | Optionnel | 1.00 |