UNIL
le savoir vivant
Vous êtes ici: UNIL > L'enseignement > Fiche de cours
Français | English   Imprimer   

Fiche de cours

Phylogénie et méthodes comparatives

Phylogeny and Comparative Methods

Faculté de gestion: Ecole de biologie (FBM-BIO)

Responsable(s): Nicolas Salamin

Période de validité: 2018 -> 2018

Pas d'horaire défini.

Cours

Semestre de printemps
7 heures par semestre

Langue(s) d'enseignement: anglais
Public: Non
Crédits: 0

Objectif

1) Connaître et comprendre les méthodes de reconstructions phylogénétiques
2) Pouvoir utiliser les arbres pour tester les processus d'évolution des gènes et des organismes

Contenu

Les sujets abordés durant le cours et les exercices sont les suivants:

I. Méthodes de reconstruction
- Qu'est qu'un arbre phylogénétique et comment l'interpréter
- Méthodes de reconstruction:
a) critères d'optimisation et modèles d'évolution
b) recherche de l'arbre optimum
c) méthodes Bayesienne
- Comment être sûr d'avoir le bon arbre?

II. arbres phylogenetiques comme outil
- Détection de sélection positive dans un gène codant
- Tests de co-évolution et co-spéciation
- Macro-évolution:
a) dater les temps de divergence
b) mode et tempo d'évolution spécifique
c) test d'innovations clé
- Phylogénie et conservation

Bibliographie

Felsenstein, J. 2003. Inferring phylogenies. Sinauer Associates.
Page, R. 2003. Tangled trees: Phylogeny, cospeciation, and coevolution. University of Chicago Press.
Purvis, A., Gittleman, J.L. and Brooks, T. 2005. Phylogeny and conservation. Cambridge University Press.
Swofford, D.L., Olsen, G.K., Waddell, P.J. and Hillis, D.M. 1996. Phylogeny reconstruction. Pages 407-514 In Molecular Systematics (D.M. Hillis, C. Moritz, B.K. Mable, eds.). Sinauer Associates.
Yang, Z.H. 2006. Computational Molecular Evolution. Oxford University Press.

Exigences du cursus d'études

aucun

Informations supplémentaires

http://www.unil.ch/phylo/teaching/pmc.html

Canton de Vaud
Swiss University
Unicentre  -  CH-1015 Lausanne  -  Suisse  -  Tél. +41 21 692 11 11  -  Fax  +41 21 692 26 15