UNIL
Vous êtes ici: UNIL > L'enseignement > Fiche de cours
Français | English   Imprimer   

Fiche de cours

Modélisation spatiale des espèces et de la biodiversité

Spatial Modelling of Species and Biodiversity

Faculté de gestion: Ecole de biologie (FBM-BIO)

Responsable(s): Antoine Guisan
Intervenant(s): -

Période de validité: 2020 -> 2020

Pas d'horaire défini.

Exercices

Semestre de printemps
14 heures par semestre

Langue(s) d'enseignement: anglais
Public: Non
Crédits: 0

Objectif

Les modèles prédictifs de distribution d'espèces (SDM) prennent toujours plus d'importance en écologie et biologie de la conservation. Ce cours se propose de présenter les différentes approches existantes, et leurs avantages et limitations respectifs, ainsi que les différentes étapes de construction d'un SDM, telles que la préparation des prédicteurs environnementaux, l'ajustement du modèle, les prédictions spatiales dans un SIG ou l'évaluation des prédictions. Les différentes approches prédictives seront particulièrement discutées dans différents contextes de biologie de la conservation (changements climatiques, espèces rares, espèces invasives)

Contenu

Chap 1. Introduction générale. Théorie biologique derrière les modèles: concept de la niche, la notion d'espèce et les assemblages d'espèces, compétition, dispersion. Survol des principales approches prédictives selon le type de variable réponse ; Données utilisées (sp et prédicteurs) et échantillonnage de terrain. Des prédictions d'espèces aux prédictions des communautés.
Chap. 2. Calibration des modèles. Modèles de présences-seulement et de présences-absences. Problème des absences. Théorie statistique derrière les modèles de présence-seulement : Enveloppes, ENFA, ACP-espèce, pseudo-absences. Modèles de régression et de classification (arbres), maximum de vraisemblance, lien entre modèles statistiques et théorie écologique, modèles d'ensemble (ensemble modelling and forecasting).
Chap. 3. Evaluation des modèles : Evaluation interne (rééchant.) versus externe (données indép.): validation croisée, jackknife, bootstrap, prédiction dans nouvelle région (transposabilité), incertitudes.
Chap. 4. Postulats d'application des SDMs. Pseudo-équilibre, conservatisme de la niche, complétion de la niche, niche réalisée, et autres postulats plus généraux.

Evaluation

Examens organisés par l'Ecole de Biologie. Contrôle continu. 1/2 Rapport des travaux pratiques, 1/2 présentation d'article.

Bibliographie

Guisan, A. & Zimmermann, N.E. (2000). Predictive habitat distribution models in ecology. Ecological Modelling 135(2-3): 147-186.
Guisan A, Thuiller W (2005) Predicting species distribution: offering more than simple habitat models. Ecology Letters, 8, 993-1009.
Guisan et al. (2013) Predicting species distributions for conservation decisions. Ecology Letters 16: 1424-1435.

Exigences du cursus d'études

Si possible, cours d'Analyse Spatiale et SIG (ANSPAT) du Master BEC au semestre précédent (non strictement nécessaire).

Informations supplémentaires

http://www.unil.ch/ecospat

Unicentre - CH-1015 Lausanne - Suisse
Tél. +41 21 692 11 11
Canton de Vaud
Swiss University