Fiche de cours
Génomique, protéomique et génétique quantitative
Genomics, Proteomics and Quantitative Genetics
Faculté de gestion: Ecole de biologie (FBM-BIO)
Responsable(s): Paul Franken
Pas d'horaire défini.
Cours
Semestre de printemps
24 heures par semestre
Langue(s) d'enseignement: anglais, français
Public: Non
Crédits: 0
Objectif
Se familiariser avec les diverses approches et les technologies expérimentales afin de connaître les principes fondamentaux des gènes et la fonction du génome
Contenu
Ce cours consiste en quatre composantes majeures. Celles-ci donnent un aperçu général de la génomique fonctionnelle; de la transcription de gène, à la protéine, et, finalement, au phénotype. En plus de donner des bases, les techniques utilisées dans les diverses seront mises en évidence.
1. Les technologies génomiques et leurs applications :
- Technologies de séquençage; de Sanger à Gattaca (historique, principes techniques, limitations, évolutions et futur)
- Regard technique sur les applications, leurs intérêts et leurs limitations
2. Epigénétique et la structure de la chromatine :
- Qu'est-ce que l'épigénétique?
- Dynamique de la structure de la chromatine
- Avantages et inconvénients des techniques utilisées pour quantifier et identifier les différentes modifications de la chromatine
3. La protéomique :
- Introduction à la protéomique d'expression (analyse des niveaux d'expression de protéine et des variations de ces derniers) et à la protéomique fonctionnelle (relations fonctionnelles entre les protéines)
- Introduction aux techniques de séparation (chromatographie liquide, électrophorèse en 2D, spectrométrie de masse), les applications typiques de ces techniques et l'analyse bioinformatique
- Discussion du potentiel et des limitations de l'approche protéomique pour l'étude des systèmes biologiques complexes
4. L'analyse de Traits Quantitatifs :
- Introduction à la génétique quantitative et les problèmes statistiques liées à la cartographie des Quantitative Trait Loci (QTL)
- Stratégies de Cartographie des traits quantitatifs chez l'homme et dans les organismes modèles et non-modèles
- Introduction à "Systems Genetics"
- L'utilisation d'un outil de cartographie des QTL ; WebQTL