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Fiche de cours

Modélisation écogéographique des espèces et de la biodiversité

Ecogeographical modelisation of natural data - Multivariate analyses

Faculté de gestion: Faculté des géosciences et de l'environnement (FGSE)

Responsable(s): Antoine Guisan
Intervenant(s): -

Période de validité: 2022 ->

Pas d'horaire défini.

Travaux pratiques

Semestre d'automne
9 djb heures par semaine
Apériodique
Langue(s) d'enseignement: français
Public: Oui
Crédits: 2, 3

Objectif

Enseigner les bases de biogéographie, de statistique et de méthodologie nécessaire à la compréhension, l'ajustement et l'évaluation des modèles prédictifs de distribution d'espèces et des communautés biologiques, au moyen d'exemples avancés dans le logiciel R.

Contenu

Cet enseignement comprend des cours théoriques, des travaux pratiques dans le logiciel R et des lectures et présentations d'articles scientifiques. Les cours enseignent les bases théoriques et statistiques de la modélisation de distribution d'espèces (SDMs) et de communautés biologiques. Les travaux pratiques sont basés sur les logiciels R (statistiques) et ArcGIS. Des articles sont assignés le premier jour à des groupes de 2-4 étudiants. Ils sont présentés oralement lors du dernier cours. Cours théoriques: 1. Théorie, postulats de base et principes de base des modèles prédictifs de distribution d'espèces (PSD). 2. Calibration des modèles. 3. Evaluation des modèles. 4. Postulats de travail et exemple d'application des modèles. Travaux pratiques: TP1. Techniques statistiques et calibration des modèles. TP2. Evaluation des modèles et incertitude. TP3. Projections dans le temps et l'espace. TP4. Modélisation de la qualité d'habitat et distribution des espèces avec Biomod2. Présentations d'articles: 1 article pour 3-4 étudiants, choisis pour représenter différentes applications des SDMs.

Evaluation

Rapport des travaux pratiques noté. Présentation d'article notée. Note finale: moyenne des deux notes (pratique et article)

Bibliographie

Guisan, A., Thuiller, W. & Zimmermann, N.E. (2017) Habitat suitability and distribution models, with applications in R. Cambridge University Press.

Exigences du cursus d'études

Bases de biologie générale (niveau maturité), statistiques de base
Bon niveau de base dans le logiciel R

UtilisationCode facultéStatutCrédits
Enseignements supplémentaires en sciences de l'environnement (hors cursus MSc) (2006 ->) ›› Enseignements supplémentaires géosciences et environnement (hors cursus MA)Optionnel2.00
Maîtrise universitaire ès Sciences en biogéosciences (2015 ->) ›› M2 - Méthodes analytiques et techniquesObligatoire2.00
Maîtrise universitaire ès Sciences en biogéosciences (2022 ->) ›› M2 - Méthodes analytiques et techniquesObligatoire3.00
Maîtrise universitaire ès Sciences en biogéosciences (2023 ->) ›› M2 - Méthodes analytiques et techniquesObligatoire3.00
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