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Fiche de cours

Modélisation spatiale I: distribution d'espèces: Distribution géographique d'espèces, prédictions spatiales, biologie de la conservation

Predicting species distributions

Faculté de gestion: Ecole de biologie (FBM-BIO)

Responsable(s): Antoine Guisan
Intervenant(s): -

Période de validité: 2004 -> 2004

Pas d'horaire défini.

Cours

Semestre d'été
14 heures par semestre

Langue(s) d'enseignement: français
Public: Oui
Crédits: 0

Objectif

Les modèles prédictifs de distribution des habitats potentiels d'organismes (MPDH) prennent toujours plus d'importance en biologie de la conservation. Ce cours se propose de présenter les différentes approches existantes, et leurs avantages et limitations respectifs, ainsi que les différentes étapes de construction d'un MPDH, telles que la préparation des prédicteurs environnementaux, l'ajustement du modèle, les prédictions spatiales dans un SIG ou l'évaluation des prédictions. Les différentes approches prédictives seront particulièrement discutées dans un contexte de conservation biologique.

Contenu

1. La théorie biologique derrière les modèles: concept de la niche, la notion d'espèce et les assemblages d'espèces, pseudo-équilibre, compétition, dispersion
2. La théorie statistique derrière les modèles: lois de distribution, tests d'inférence, maximum de vraisemblance, deviance
3. Les différentes approches prédictives: enveloppes climatiques, ACP sur données espèces, CART, GLM, GAM, approche bayésienne, ENFA, ANN, GARP
4. Evaluation des modèles: split-sample, jackknife, validation croisée, bootstrap, principales mesures d'évaluation (ROC, Kappa, Somer's D, HL test,
5. Application des modèles en biologie de la conservation: potentiel invasif, espèces rares, scénarios de changements climatiques

Bibliographie

Guisan, A. & Zimmermann, N.E. 2000. Predictive habitat distribution models in ecology. Ecological Modelling 135(2-3): 147-186.

Scott, J.M., Heglund, P.J., Haufler, J.B., Morrison, M., Raphael, M.G., Wall, W.B. & Samson, F. (2002) Predicting species occurrences: issues of accuracy and scale. Island Press, Covelo, California.

Exigences du cursus d'études

Cours d'Analyse Spatiale, Tronc commun Master BEC

Informations supplémentaires

http://ecospat.unil.ch

Unicentre - CH-1015 Lausanne - Suisse
Tél. +41 21 692 11 11
Canton de Vaud
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